小RNA(Small non-coding RNA,
sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,广泛参与调控细菌各方面的功能。由于不同sRNA调控的靶标及其调控机制不相同,多数已鉴定sRNA
的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA
是否存在新的调控靶标及调控机制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物调控型RNA研究的热点。

中国林业网6月26日讯近日,中国林科院林业所张建国研究员课题组在揭示长链非编码RNA(long
noncoding
RNA,lncRNA)在沙棘果实花青素合成中的调控作用方面取得重要进展,研究成果以“Transcriptomic
and functional analyses unveil the role of long non-coding RNAs in
anthocyanin biosynthesis during sea buckthorn fruit ripening”
为题在线发表于DNA
Research(
lncRNA是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200bp以上,具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控。本研究通过对沙棘果实不同发育时期的LncRNA、microRNA和mRNA的整合分析,鉴定出118条差异表达的LncRNA和32条差异表达的microRNA,通过对靶基因进行注释,发现这些差异表达的LncRNA与维生素C、类黄酮和胡萝卜素的合成有关。进一步对两条lncRNA(LNC1和LNC2)进行沉默和亚细胞定位分析,发现LNC1和LNC2能够通过内源性模拟靶标(eTMs)的方式来分别调控miR-156a和miR-828a的表达进而分别降低和升高转录因子SPL9和MYB114的表达,从而调控花青素的合成和累积。该研究为理解沙棘果实生长发育和品质形成的调控机制提供了重要证据。(中国林科院林业所)

近期,中国科学院武汉病毒研究所研究员陈士云带领的病原细菌学科组在sRNA功能及调控机制研究方面取得进展。该研究以临床重要的机会致病菌——铜绿假单胞菌为对象,通过生物信息学等方法鉴定出依赖于细菌压力耐受因子RpoS的sRNA—RgsA的2个调控靶标:酰基转运蛋白AcpP及全局性调控蛋白Fis;在伴侣蛋白Hfq的辅助下,RgsA通过不完全互补配对方式调控这2个靶标的表达。进一步研究发现,fis
mRNA有两个起始密码子,且均受到RgsA的调控,并找到了调控的关键区域。RgsA还通过抑制细菌生长、运动性及促进毒素的分泌,参与调控细菌的毒力及生长等表型。该研究首次将全局性转录调控因子Fis与压力相关因子RpoS通过sRNA的调控联系起来,揭示了细菌在应对外界环境信号及压力条件时,RgsA反馈调控AcpP和Fis这2个靶标的具体机制。

该研究由助理研究员卢培等人完成,论文在线发表在《分子微生物学》(Molecular
Microbiology
)。该研究得到国家自然科学基金青年基金项目(#www.204.net,31300124)的资助。

文章链接

www.204.net 1

RgsA 通过反义互补配对直接调控fisacpP表达

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